BIO INFORMATICIEN EN RECHERCHE DEVELOPPEUR GESTIONNAIRE PIPELINES BIOINFORMATIQUES (F./H.)

CDD
Non précisé
Non-Cadre
Dès que possible
Horaires normaux
Temps plein
Ouvert aux travailleurs handicapés
BIO INFORMATICIEN EN RECHERCHE DEVELOPPEUR GESTIONNAIRE PIPELINES BIOINFORMATIQUES (F./H.)

Description du poste

Grade Grille de référence I.H.

Type de contrat Contractuels acceptés

Pourcentage d’activité 100%

DÉFINITION :

Immun4Cure (I4C) est institut hospitalo-universitaire (IHU) dont l'objectif est de développer de nouvelles thérapies innovantes afin de lutter contre les maladies auto-immunes. Ce projet ambitieux repose tout d'abord sur un volet clinique important comprenant différentes cohortes de patients associées à différentes maladies auto-immunes comme le lupus, l'arthrite rhumatismale ou la sclérodermie. Par ailleurs, I4C fonde aussi son effort sur de la recherche fondamentale autour de l'auto-immunité centrée sur les pathologies visées en clinique. Les travaux de recherche tant fondamentaux qu'auprès des patients impliquent des technologies de génomique à haut débit et donc des données volumineuses et complexes. Ces données seront acquises selon des modalités diverses : transcriptomique, protéomique, séquençage de l'ADN, imagerie. Les technologies utilisées seront-elles aussi diverses et parmi les plus avancées : cellules uniques, biologie spatiale, images, séquençage Illumina mais aussi en long reads, etc

Horaires : 9h-18h Repos : samedi-dimanche

ACTIVITÉS PRINCIPALES :

 Développement de scripts implémentant les pipelines génomique et transcriptomique

 Gestion des versions de ces scripts.

 Développement des progiciels et programmation nécessaires à l’exploitation des données biologiques et médicales

 Formation de personnes aux techniques et procédures de son domaine, et à leur application

 Paramétrage des outils, logiciels, systèmes relevant de son domaine d’activité

 Participation aux publications scientifiques et médicales en interne ou externe

 Traitement et analyse de l’information/données médicale et/ou biologique : extraction, regroupement, représentation graphique

 Veille professionnelle

ACTIVITÉS SPÉCIFIQUES LIÉES AU POSTE :

 Diffuser et valoriser les résultats et réalisations technologiques sous forme de rapports, brevets, publications, présentations orales.

 Analyse des données OMICS (génomique et transcriptomique)

CORRESPONDANCE STATUTAIRE (grade) :

 Ingénieur hospitalier

 Catégorie A

Autres détails

Compétences recherchées

  • Organisation
  • Autonomie
  • Dynamisme
  • Esprit d'équipe
  • Sens de l'initiative
  • Adaptabilité
  • Sens relationnel
  • Rigueur
  • Bioinformatique
  • Méthode agile
  • - Python
  • - SQL

Profil recherché

SAVOIR ETRE REQUIS :

 Méthode et rigueur

 Motivation

 Esprit d'équipe

 Adaptabilité

 Organisation

 Autonomie

 Précision

 Dynamisme

 Esprit d’initiative

 Sens du relationnel

PRÉREQUIS INDISPENSABLES :

 Une intégration parfaite et aussi indispensable avec le ou la gestionnaire du système de base de données relationnel.

 Une bonne culture générale en bio-informatique avec l'expérience de plusieurs types de données.

 BAC + 5

PRÉREQUIS SOUHAITÉS :

 Méthodes agiles

 Familiarité avec un système de développement de workflow bio-informatique, par exemple Nextflow

 Une expérience préalable dans un environnement de production

PARTICULARITÉS DU POSTE :

 Forte interaction attendue avec les bio-informaticiens spécialistes des différents types de données qui apporteront aide et conseils

 Programmation en Python, requêtes SQL et bases de données

Description de l'établissement

180 métiers, 1 sens commun.

Rejoignez une communauté de 12 000 professionnels qui, au quotidien, font battre le cœur du CHU de Montpellier ! Classé parmi les premiers hôpitaux français, le CHU de Montpellier est un acteur leader du soin, de la recherche, de l’enseignement et de la formation sur son territoire.

Intégrer nos équipes, c’est évoluer dans un environnement de pointe, et trouver du sens dans les valeurs du service public pour offrir à chacun, quelle que soit sa situation, les meilleurs soins.