
Description du poste
Grade Grille de référence I.H.
Type de contrat Contractuels acceptés
Pourcentage d’activité 100%
DÉFINITION :
Immun4Cure (I4C) est institut hospitalo-universitaire (IHU) dont l'objectif est de développer de nouvelles thérapies innovantes afin de lutter contre les maladies auto-immunes. Ce projet ambitieux repose tout d'abord sur un volet clinique important comprenant différentes cohortes de patients associées à différentes maladies auto-immunes comme le lupus, l'arthrite rhumatismale ou la sclérodermie. Par ailleurs, I4C fonde aussi son effort sur de la recherche fondamentale autour de l'auto-immunité centrée sur les pathologies visées en clinique. Les travaux de recherche tant fondamentaux qu'auprès des patients impliquent des technologies de génomique à haut débit et donc des données volumineuses et complexes. Ces données seront acquises selon des modalités diverses : transcriptomique, protéomique, séquençage de l'ADN, imagerie. Les technologies utilisées seront-elles aussi diverses et parmi les plus avancées : cellules uniques, biologie spatiale, images, séquençage Illumina mais aussi en long reads, etc
Horaires : 9h-18h Repos : samedi-dimanche
ACTIVITÉS PRINCIPALES :
Développement de scripts implémentant les pipelines génomique et transcriptomique
Gestion des versions de ces scripts.
Développement des progiciels et programmation nécessaires à l’exploitation des données biologiques et médicales
Formation de personnes aux techniques et procédures de son domaine, et à leur application
Paramétrage des outils, logiciels, systèmes relevant de son domaine d’activité
Participation aux publications scientifiques et médicales en interne ou externe
Traitement et analyse de l’information/données médicale et/ou biologique : extraction, regroupement, représentation graphique
Veille professionnelle
ACTIVITÉS SPÉCIFIQUES LIÉES AU POSTE :
Diffuser et valoriser les résultats et réalisations technologiques sous forme de rapports, brevets, publications, présentations orales.
Analyse des données OMICS (génomique et transcriptomique)
CORRESPONDANCE STATUTAIRE (grade) :
Ingénieur hospitalier
Catégorie A
Autres détails
Compétences recherchées
- Organisation
- Autonomie
- Dynamisme
- Esprit d'équipe
- Sens de l'initiative
- Adaptabilité
- Sens relationnel
- Rigueur
- Bioinformatique
- Méthode agile
- - Python
- - SQL
Profil recherché
SAVOIR ETRE REQUIS :
Méthode et rigueur
Motivation
Esprit d'équipe
Adaptabilité
Organisation
Autonomie
Précision
Dynamisme
Esprit d’initiative
Sens du relationnel
PRÉREQUIS INDISPENSABLES :
Une intégration parfaite et aussi indispensable avec le ou la gestionnaire du système de base de données relationnel.
Une bonne culture générale en bio-informatique avec l'expérience de plusieurs types de données.
BAC + 5
PRÉREQUIS SOUHAITÉS :
Méthodes agiles
Familiarité avec un système de développement de workflow bio-informatique, par exemple Nextflow
Une expérience préalable dans un environnement de production
PARTICULARITÉS DU POSTE :
Forte interaction attendue avec les bio-informaticiens spécialistes des différents types de données qui apporteront aide et conseils
Programmation en Python, requêtes SQL et bases de données
Description de l'établissement
180 métiers, 1 sens commun.
Rejoignez une communauté de 12 000 professionnels qui, au quotidien, font battre le cœur du CHU de Montpellier ! Classé parmi les premiers hôpitaux français, le CHU de Montpellier est un acteur leader du soin, de la recherche, de l’enseignement et de la formation sur son territoire.
Intégrer nos équipes, c’est évoluer dans un environnement de pointe, et trouver du sens dans les valeurs du service public pour offrir à chacun, quelle que soit sa situation, les meilleurs soins.