Description du poste
DEFINITION
Ingénieur en Bio-informatique et en informatique
ACTIVITES PRINCIPALES
L’ingénieur(e) participera à l’organisation de la plateforme BIO2M. Il mettra en place les logiciels d’analyse pour le traitement des données de séquençage haut débit, assurera leur mise à jour et les développements informatiques pour automatiser les procédures avec le logiciel de gestion (Snakemake) et les logiciels de conception d'INDEX de données à grande échelle. Nous recrutons un ingénieur informaticien/bio-informaticien expérimenté pour les taches désignées.
• La personne sera également en charge de la gestion des données et participera aux formations qui seront développées pour les utilisateurs
• La personne sera en contact avec les demandeurs de prestations pour la conception de l'étude et le rendu de résultats
ACTIVITES SPECIFIQUES LIEES AU POSTE
Les activités spécifiques liées au poste sont :
- la création d'index à partir de cohortes (données RNAseq ou Omics) fournies par les demandeurs d’un projet.
- L'utilisation et la conception de gestionnaire de workflow
- Le maintien et l'amélioration du site Web (TranSipedia)
Autres détails
Diplômes recherchés
- MASTER
Profil recherché
SAVOIR FAIRE REQUIS : Bioinformatique des traitements des données NGS
Compétences techniques
➢ Gestion de workflow
➢ Indexation de données et programmation
➢ Web développement
➢ Pipelines NGS (maitrise)
Compétences relationnelles
➢ Bonne relation pour communiquer avec demandeurs
➢ Contribution à l'organisation…
➢ Gestion des logiciels
➢ Compétences spécifiques liées au poste
➢ Bioinformatique : analyse NGS de RNAseq
SAVOIR-FAIRE SPECIFIQUES LIES AU POSTE
Indexation de données de séquençage haut-débit et Bonne compréhension des procédures et des outils d'analyse de données OMICS. Utilisation de l’outil Reindeer
SAVOIR-ETRE REQUIS
➢ Bon relationnel pour communiquer avec les demandeurs de projets
➢ Savoir mettre en forme les résultats, gérer l'archivage, communiquer et partager les informations avec les personnes de l'équipe et les extérieurs CONNAISSANCES ASSOCIEES
➢ Connaissances biologiques de base (Biologie Moléculaire) (N1)
➢ Anglais (N1)
PREREQUIS INDISPENSABLES
Master 2 bio-informatique, expérience professionnelle en bio-informatique
PREREQUIS SOUHAITES
Bonnes connaissances en informatique (web, programmation python)
PARTICULARITES DU POSTE
Double compétence en bio-informatique et informatique
Description de l'établissement
180 métiers, 1 sens commun.
Rejoignez une communauté de 12 000 professionnels qui, au quotidien, font battre le cœur du CHU de Montpellier ! Classé parmi les premiers hôpitaux français, le CHU de Montpellier est un acteur leader du soin, de la recherche, de l’enseignement et de la formation sur son territoire.
Intégrer nos équipes, c’est évoluer dans un environnement de pointe, et trouver du sens dans les valeurs du service public pour offrir à chacun, quelle que soit sa situation, les meilleurs soins.